臭氧用于食品制藥GMP車間的殺菌消毒對食品加工來講，通過控制病原體所需的營養成分來控制病原體難以達到目的，因為除特別情形之外，大多數食品為病原體生長提供了充足的營養。食品加工可以通過分別控制食品中管道殺菌和水處理殺菌消毒，或通過特定的包裝技術調節氣體來控制病原體的生長。  在食品加工中的生物性污染的主要途徑是：(1)生熟不分；(2)不潔的容器；(3)從業人員不潔的手；(4)從業人員為帶菌(病毒)者；(5)空氣中塵埃；(6)未經消毒或消毒不徹底的設備 ；(7)未消毒或未徹底消毒的包裝材料；(8)地面；(9)其他不潔物品。如何控制好微生物對食品的污染，已成為人們關注的話題。來源：1.食品生產車間工藝布局不合理，存在交叉污染、防蟲防鼠防塵設施不足、作業人員不注意個人衛生或患有傳染性等疾病沒及時離崗，是引起食品二次污染的主要原因。2.食品冷卻和包裝車間潔凈度要求很高，但企業缺乏相關專業知識，消毒殺菌方法不當,生產車間的空氣、設備、工器具（包括操作臺）、包裝材料未經有效消毒或消毒不徹底，這些物品上殘存的微生物與食品接觸后迅速生長繁殖，也是引起食品二次污染的重要原因。3  無菌包裝區、GMP車間的細菌感染  包裝材料和密封容器、灌裝設備都需要達到無菌狀態；灌裝和封蓋要在無菌環境下進行，如果消毒殺菌不當，或消毒不徹底，都會造成二次污染的重要原因。